Der Ärzte- und Ärztinnenverband Long COVID richtet mehrere Fachgruppen ein, aufgeteilt nach verschiedenen Zuständigkeitsbereichen. Jedes Mitglied kann nur einer Fachgruppe zugehörig sein. Die Entscheidung welcher wird bei Aufnahme getroffen. Ein Wechsel der Fachgruppe ist aber im begründeten Einzelfall auch noch während der laufenden Mitgliedschaft möglich. Es bestehen folgende Fachgruppen:
Hausärzte (gemäß § 73 SGB V ohne Kinder- und Jugendmedizin)
Intensivmedizin
Hygiene-, Umwelt- und Arbeitsmedizin sowie öffentliches Gesundheitswesen
Gynäkologie, Urologie und Reproduktionsmedizin
HNO- (insbesondere Phoniatrie und Pädaudiologie) und Augenärzte sowie Dermatologen
Labor (Humangenetik, Biochemie, Pharmakologie, Labor- und Transfusionsmedizin) und Physiologie
Innere Medizin (alle Facharztbereiche und Schwerpunktbereiche der inneren Medizin außer hausärztlich tätige Internisten)
Kinder- und Jugendmedizin
Psychiatrie und Psychosomatik
Mikrobiologie, Virologie und Infektionsepidemiologie
Neurologie
Physikalische und rehabilitative Medizin
Radiologie, Strahlentherapie und Nuklearmedizin